Zupełnie inaczej wygląda świat myszy Bluetooth. Są wykrywalne na standardowym interfejsie Bluetooth wbudowanym w laptop lub notebook. Zasięg jest znacznie większy niż połączeń RF i po każdym uruchomieniu się systemu synchronizacja następuje automatycznie. Dodatkowo myszka posiada wyłącznik baterii i sygnalizację działania.

Przykładem ciekawej myszy bluetooth może być Mighty Mouse Apple. Myszka ta świetnie współpracuje z Windowsem i jest wykrywana jako urządzenie HID. Nadzwyczajnym tematem jest tu skrol w postaci tracball oraz całkowity brak przycisków. Myszka wykrywa obecność palca na części obudowy (lewy lub prawy click) i click jest wspólny dla obu przycisków całą obudową. Czujnik laserowy jest niesamowicie precyzyjny i działa na każdej powierzchni stołu, blatu, czy nawet tkaniny spodni na kolanie. Przykładowa myszka łączy się z Bluetoothem w momencie włączenia systemu po naciśnięciu przycisku lub poruszeniu trackballu. Co ciekawe można ją synchronizować z dowolnym laptopem, tabletem obsługującym urządzenia wskazujące HID, bez konieczności stosowania jakichkolwiek sterowników.